Se han realizado los muestreos de suelo en 3 localidades: Castejón del Puente (extensivo secano), Sádaba (extensivo secano) y Pina de Ebro (extensivo regadío), gracias a la colaboración de seis agricultores interesados en el Proyecto. En cada localidad se han muestreado suelos con manejos diferenciados (siembra directa, laboreo convencional, uso de cubiertas, cultivo ecológico), así como distintos tipos de suelo. Han sido un total de 8 manejos diferenciados.
Se han tomado muestras para determinar varios indicadores de calidad del suelo que se pueden haber visto afectados por el historial de manejo de las parcelas. Entre estos indicadores se incluye la biomasa microbiana, respiración basal, caracterización de las poblaciones de hongos y bacterias del suelo, carbono orgánico, nitrógeno orgánico, textura, fertilidad (nitratos, fósforo, potasio), pH, y estabilidad de agregados al agua. Además, se evaluará la mesofauna encontrada en las distintas parcelas mediante un índice de calidad biológico del suelo relacionado con las poblaciones de artrópodos (QBS-ar).